A corte também aceitou acusá-la de violência privada, instigação a delinquir, atuação em bando, intimidação pública, lesões pessoais em grau de cumplicidade, concurso real ao delito e posse e uso ilícito de objetos qualificados como arma de guerra (bomba de gás lacrimogêneo).

Após sua detenção, foi levado ao complexo judicial de Paloquemao, no centro de Bogotá, onde um juiz o acusará de rebelião e associação para delinquir.

Em agosto, Guzmán, que se diz inocente, foi acusado e considerado culpado pela Justiça colombiana pelos crimes de lavagem e captação ilegal de recursos, enriquecimento ilícito e concerto para delinquir, segundo o "El Tiempo".